De acuerdo con la FGR, los siete agentes son investigados por su probable responsabilidad en el delito de desaparición forzada de personas, por lo que a través de la Fiscalía Especializada en Materia de Derechos Humanos (FEMDH), se obtuvo un auto de formal prisión en su contra.
Fue el Juez Primero de Distrito de Procesos Penales Federales en Jalisco quien decretó lo anterior en contra de los agentes Samuel “L”, Damaso “S”, Juan “R”, Ernesto “H”, Francisco “P”, Abel “M” y Daniel “C”, cuya aprensión tuvo lugar “luego de los trabajos de campo y diversas diligencias” que realizó la FGR, a través de la Fiscalía Especializada en Investigación de los Delitos de Desaparición Forzada.
Los agentes detenidos el pasado 6 de agosto y ahora en prisión son señalados por su presunta participación en el delito de desaparición forzada, cometido en contra de integrantes del Ejército Popular Revolucionario (EPR), Edmundo Reyes Amaya y Gabriel Cruz.

El auto de formal prisión se dictó en contra del exdirector de la Agencia Estatal de Investigación (AEI) de la Fiscalía de Oaxaca, Daniel Camarena Flores, 2 mandos y 4 agentes ministeriales de la institución entre los que están Juan José Ramírez López, exmando policial en la Mixteca; Abel Adán Morales López, mando en la costa; Francisco Pascual Cervantes, “El Garapiñado”, jefe de grupo; y los agentes ministeriales: Ernesto Herrera Hernández, Dámaso Santiago Peralta y Samuel Alonso Lechuga Graniel.
El exprocurador de justicia en el sexenio del gobernador oaxaqueño, Ulises Ruiz, Evencio Nicolás Martínez Ramírez, señalado por estos mismos hechos, se encuentra prófugo de la justicia, pues existe una orden de aprehensión en su contra.