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Las víctimas han señalado como autores materiales e intelectuales a José Luis Chávez Salinas (actual agente municipal de Huazantlán del Río), Camerino Dávalos Larrinzar, Laura Fiallo Sandoval, Máximo Leyva Piamonte, Teófila Ochoa, Emanuel Villaseñor Bustillos, Israel Oviedo Aldama y Ramiro Escudo Comonfort, entre otros.
De manera simultánea a este bloqueo carretero en el Istmo de Tehuantepec, los desplazados y familiares de las víctimas se manifestaron en las instalaciones de la Agencia Estatal de Investigaciones (AEI) adscrita a la Fiscalía General del Estado de Oaxaca (FGEO) también para exigir que la instancia comience con la detención de los responsables materiales e intelectuales de la masacre.

La masacre de San Mateo del Mar se dio como consecuencia de un conflicto político-social que la comunidad arrastraba desde 2019, cuando pese a la violencia en la elección de autoridades, se validó el triunfo de Bernardino Ponce Hinojoza como presidente municipal, a quienes las autoridades comunitarias desconocieron como edil.
El problema se agudizó cuando un grupo armado supuestamente al servicio del presidente municipal quemó vehículos y asesinó al suplente del agente municipal de Huazantlán del Río.